中国科学院地质与地球物理研究所于1999年由原地质研究所和地球物理研究所两所整合而成。整合前的两个研究所都有长达50余年的历史和丰厚的科研成果，在国内外地学界具有很高的学术地位。著名地质学家侯德封先生曾任原地质研究所第一任所长，著名地球物理学家赵九章先生曾任原地球物理研究所第一任所长。

地质与地球物理研究所是从事固体地球科学研究与教育的综合性学术机构。研究所以固体地球各圈层相互作用及其资源、环境、工程地质问题作为主攻方向。1999年以来，研究所在科研布局上基本形成了地球动力学研究、环境与灾害研究、矿产资源研究的三足鼎立式研究格局。研究所共设以下九个研究室：地球深部结构与过程研究室、岩石圈构造演化研究室、青藏高原研究室、新生代地质与环境研究室、空间电磁环境研究室、工程地质与应用地球物理研究室、油气资源研究室、固体矿产资源研究室、水资源与地壳流体研究室；研究所同时有岩石圈构造演化、矿产资源、工程地质3个中国科学院重点实验室，另外在地球磁场与地球外核动力学、干旱区环境演化与全球变化、俯冲碰撞造山的岩石学过程等研究方向上建成3个国家自然科学基金委优秀创新研究群体。近年来，研究所承担了多项国家重点基础研究发展规划(973)项目、国家自然科学基金重点项目、国家高技术研究发展计划(863)项目的科研工作，取得一批重要科研成果。代表性的奖项是著名第四季地质学家刘东生院士获得的2003年度国家最高科学技术奖。

研究所从事科研活动的人员共有177人，其中中国科学院院士11人、中国工程院院士１人、研究员60人。另外，研究所共有支撑系统固定人员26人，固定管理人员19人。研究所是国家最早确定的硕士、博士研究生培养基地和博士后流动站单位，是中国科学院博士生重点培养基地，现有在读博士生292人，硕士生95人，在站博士后50人。

研究所拥有开展固体地球科学研究的大型观测和测试分析仪器，主要包括：地球物质成分与物质性质分析系统、地球深部结构观测系统、地质年代学测定系统、地磁与电离层观测台链、古环境数据分析系统、数据处理计算系统，为地球科学测试、观测和实验提供了必要条件。

研究所图书馆目前藏书约35000余册，中外文学术期刊现刊350种。与国际著名大学和研究机构保持长期的学术交流与合作研究。研究所主办的国家一级学术刊物有：地球物理学报（SCI收录）、岩石学报（SCI收录）、第四纪研究、地质科学、工程地质学报、地球物理学进展。研究所还是三个国家一级学会的挂靠单位，它们是中国地球物理学会、中国岩石力学与工程学会、中国第四纪研究会。